More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01987 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01987  peptidase  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  58.43 
 
 
183 aa  191  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  52.98 
 
 
230 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  53.72 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  47.46 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  36.82 
 
 
194 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  41.4 
 
 
198 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  47.14 
 
 
377 aa  114  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  45.39 
 
 
446 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  43.8 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  35.86 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  40.83 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  38.67 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  39.32 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  46.9 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  40.68 
 
 
174 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  39.68 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  38.52 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  38.89 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  39.17 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  38.33 
 
 
327 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 
327 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  39.17 
 
 
327 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  38.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  44.79 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  38.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  38.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  38.33 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  40.83 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  34.91 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  40.52 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  44.79 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  44.79 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  45.92 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  41.96 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  41.96 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  43.75 
 
 
170 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  42.71 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  40.91 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  40.19 
 
 
467 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  45.1 
 
 
499 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.6 
 
 
412 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  42.71 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 
388 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  44.76 
 
 
512 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  44.66 
 
 
420 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  44.76 
 
 
471 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  44.76 
 
 
472 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  44.66 
 
 
400 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  44.66 
 
 
421 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  44.66 
 
 
421 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  44.76 
 
 
509 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.62 
 
 
569 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  38.74 
 
 
290 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  44.76 
 
 
470 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  43.69 
 
 
425 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  35.44 
 
 
450 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  41.88 
 
 
503 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  38.1 
 
 
484 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  43.69 
 
 
425 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.82 
 
 
490 aa  61.6  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.25 
 
 
533 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  27.89 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  27.89 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  35.44 
 
 
345 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.38 
 
 
479 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39.18 
 
 
353 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  38.89 
 
 
457 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  38.89 
 
 
457 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.83 
 
 
475 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  39.81 
 
 
296 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  40.38 
 
 
437 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.83 
 
 
473 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40.2 
 
 
503 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.83 
 
 
473 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  32.82 
 
 
385 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  34.39 
 
 
454 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.83 
 
 
472 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.3 
 
 
389 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.24 
 
 
480 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  42.2 
 
 
319 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  34.58 
 
 
386 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  39.22 
 
 
475 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  35.51 
 
 
386 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  41.07 
 
 
448 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  37.8 
 
 
457 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.52 
 
 
312 aa  57  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  34.43 
 
 
395 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.22 
 
 
474 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.28 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.71 
 
 
390 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  38.3 
 
 
529 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.39 
 
 
517 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.04 
 
 
277 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  33.04 
 
 
386 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.58 
 
 
303 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.85 
 
 
741 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>