More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01983 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01983  intracellular protease I  100 
 
 
109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  56.31 
 
 
181 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  61.29 
 
 
185 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  50.46 
 
 
189 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  54.29 
 
 
184 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.29 
 
 
194 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  53.92 
 
 
190 aa  120  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  53.47 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  60.22 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  53.47 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  50.93 
 
 
187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  57.84 
 
 
183 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  55.91 
 
 
168 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  55.34 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  52.94 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  55.67 
 
 
185 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  55.67 
 
 
185 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  55.67 
 
 
185 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  49.51 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  47.71 
 
 
189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  45.87 
 
 
187 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  54.84 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  50.98 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  53.4 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  55.91 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  47.71 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  53.92 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  45.87 
 
 
188 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  52.83 
 
 
189 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  52.83 
 
 
188 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  52.43 
 
 
186 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  53.54 
 
 
188 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  54.17 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  50.49 
 
 
179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  54.17 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  53.76 
 
 
186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  53.33 
 
 
184 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  49.54 
 
 
199 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  50.49 
 
 
179 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  45.87 
 
 
188 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  51.89 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.98 
 
 
175 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  49.06 
 
 
189 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  46.53 
 
 
186 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  50.47 
 
 
181 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  46.15 
 
 
245 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  49.51 
 
 
182 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  49.51 
 
 
182 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  53.92 
 
 
193 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  50 
 
 
183 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  51.38 
 
 
192 aa  103  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  45.71 
 
 
177 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  54.55 
 
 
171 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  51.58 
 
 
189 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  48.04 
 
 
186 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  53.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  53.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  47.42 
 
 
186 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  53.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  48.51 
 
 
192 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  53.41 
 
 
171 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
195 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  53.41 
 
 
171 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  46.08 
 
 
192 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  50.52 
 
 
192 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  44.95 
 
 
186 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  44.86 
 
 
182 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  45.1 
 
 
189 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  52.27 
 
 
171 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  44.86 
 
 
182 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  45.54 
 
 
186 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  43.81 
 
 
241 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  45.1 
 
 
189 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  47.52 
 
 
192 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  52.27 
 
 
171 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  45.1 
 
 
189 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  49.02 
 
 
183 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  47.57 
 
 
185 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  51.49 
 
 
183 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  48.04 
 
 
183 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  48.04 
 
 
178 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  50.98 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  45.45 
 
 
189 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  47.22 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  47.92 
 
 
173 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  43.56 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  52.27 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  45.87 
 
 
204 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  48.39 
 
 
179 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  48.48 
 
 
182 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.6 
 
 
182 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.6 
 
 
182 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.6 
 
 
182 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  43.56 
 
 
187 aa  96.7  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  45.1 
 
 
179 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  43.56 
 
 
187 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  48.89 
 
 
184 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  49.48 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  47.87 
 
 
179 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  49.48 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>