36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4211 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  100 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  90 
 
 		 130 aa  245  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  61.9 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  60.32 
 
 		 190 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  61.4 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  53.17 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  51.94 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  50 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  56.92 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  57.69 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  27.48 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  24.51 
 
 		 152 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  31.43 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  28.85 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  31.91 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30.77 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  30 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  29.79 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  27.55 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  35.79 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  28.95 
 
 		 741 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  28.87 
 
 		 269 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.14 
 
 		 746 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  26.42 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  27.55 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  28.77 
 
 		 745 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.35 
 
 		 812 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  27.4 
 
 		 745 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>