35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3691 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  100 
 
 		 513 aa  1058    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  58.9 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  39.31 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  39.78 
 
 		 312 aa  203  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  39.78 
 
 		 290 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  28.95 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  36.22 
 
 		 254 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  25.72 
 
 		 556 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  23.63 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  24.02 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  26.92 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  26.04 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.46 
 
 		 669 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  25.56 
 
 		 601 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  23.9 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  31.97 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.77 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  28.92 
 
 		 584 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.54 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  23.61 
 
 		 285 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  28.57 
 
 		 486 aa  47.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  36.59 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  33.75 
 
 		 353 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  28.91 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.53 
 
 		 588 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  34.18 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  23.59 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0495  excinuclease ABC, A subunit  23.43 
 
 		 952 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  33.33 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>