More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2950 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 		 493 aa  1000    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  94.52 
 
 		 493 aa  936    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  61.94 
 
 		 492 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  58.88 
 
 		 484 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  58.44 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  58.65 
 
 		 492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.26 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  58.44 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  57.8 
 
 		 492 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  56.47 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 491 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  48.74 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  47.69 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  46.74 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  46.9 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  49.68 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  42.68 
 
 		 491 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  42.36 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  39.54 
 
 		 483 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 		 490 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 489 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 		 486 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.21 
 
 		 480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  38.99 
 
 		 485 aa  300  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.83 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  42.72 
 
 		 490 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  38.98 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  38.66 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.28 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  34.92 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.9 
 
 		 493 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  38.2 
 
 		 533 aa  279  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 481 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.11 
 
 		 510 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  37.8 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  38.15 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 496 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 479 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 		 486 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  40.35 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  38.77 
 
 		 488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  43.02 
 
 		 484 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.17 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  38.05 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  38.94 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  33.89 
 
 		 500 aa  266  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  35.5 
 
 		 496 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  33.84 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  32.92 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  39.61 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  35.86 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.05 
 
 		 497 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 479 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.07 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.83 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  34.56 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 		 501 aa  260  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.36 
 
 		 480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  36.78 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.69 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.89 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 486 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  39.81 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.05 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.61 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>