More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3674 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  93.07 
 
 		 433 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  100 
 
 		 433 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.22 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.65 
 
 		 1182 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.15 
 
 		 1187 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.87 
 
 		 1187 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  56.02 
 
 		 1187 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  55.3 
 
 		 1187 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  54.55 
 
 		 1215 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  59.4 
 
 		 1183 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  54.48 
 
 		 1202 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  56.39 
 
 		 1181 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  52.45 
 
 		 1253 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.31 
 
 		 1207 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  52.97 
 
 		 1191 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  53.56 
 
 		 976 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.81 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  54.2 
 
 		 806 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  54.2 
 
 		 806 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.2 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.83 
 
 		 831 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  52.06 
 
 		 975 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.35 
 
 		 996 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.24 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.49 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.81 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.01 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  47.32 
 
 		 1179 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  43.36 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  43.36 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  42.76 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.36 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  42.52 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  41.8 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  45.41 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  42.63 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.59 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.95 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.95 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  40.95 
 
 		 497 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  40.7 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  40.7 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  40.7 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  40.7 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  40.16 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.03 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.54 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.56 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.3 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.88 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.25 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  39.45 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  37.47 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38 
 
 		 425 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.16 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.96 
 
 		 680 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.47 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 		 538 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.23 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.16 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  38.93 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  40.97 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.02 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  41.56 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.69 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  38.15 
 
 		 421 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.47 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  38.98 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.47 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.66 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  38.52 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  38.83 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.8 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  38.83 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  38.83 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.5 
 
 		 712 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.71 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.1 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  38.01 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  38.52 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.72 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.71 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  38.62 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  34.3 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.79 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.62 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  38.62 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>