More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2573 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1180  isocitrate lyase  73.45 
 
 		 534 aa  840    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4340  isocitrate lyase  83.21 
 
 		 528 aa  911    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5860  isocitrate lyase  83.21 
 
 		 527 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0317025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1232  isocitrate lyase  73.26 
 
 		 527 aa  812    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2353  isocitrate lyase  78.87 
 
 		 527 aa  874    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000102131  decreased coverage  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0529  isocitrate lyase  83.05 
 
 		 528 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4188  isocitrate lyase  76.94 
 
 		 545 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0755941  normal  0.12145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12313  isocitrate lyase  69.07 
 
 		 552 aa  759    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3724  isocitrate lyase  82.86 
 
 		 528 aa  912    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28420  isocitrate lyase  90.77 
 
 		 531 aa  1014    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.528136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1090  isocitrate lyase  76.28 
 
 		 531 aa  871    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.198066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01326  isocitrate lyase  76.27 
 
 		 531 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.190818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2041  isocitrate lyase  76.98 
 
 		 527 aa  864    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4801  isocitrate lyase  82.86 
 
 		 528 aa  912    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.815542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1627  isocitrate lyase  65.6 
 
 		 528 aa  724    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0384  isocitrate lyase  82.11 
 
 		 528 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4447  isocitrate lyase  83.21 
 
 		 527 aa  916    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2407  isocitrate lyase  92.84 
 
 		 531 aa  1038    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210555  normal  0.138791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0047  isocitrate lyase  78.83 
 
 		 530 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0610  isocitrate lyase  82.26 
 
 		 527 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4878  isocitrate lyase  76.04 
 
 		 544 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3157  isocitrate lyase  79.51 
 
 		 542 aa  880    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3465  isocitrate lyase  81.06 
 
 		 530 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4199  isocitrate lyase  77.32 
 
 		 545 aa  874    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1029  isocitrate lyase  81.42 
 
 		 531 aa  895    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1379  isocitrate lyase  76.18 
 
 		 545 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1448  isocitrate lyase  67.17 
 
 		 527 aa  747    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  normal  0.373019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0304  isocitrate lyase  71.97 
 
 		 531 aa  802    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4053  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 545 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2234  isocitrate lyase  78.11 
 
 		 527 aa  869    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305365  decreased coverage  0.0000429136 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1860  isocitrate lyase  65.78 
 
 		 528 aa  728    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4737  isocitrate lyase  82.26 
 
 		 526 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613526  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0943  isocitrate lyase  77.08 
 
 		 530 aa  871    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.478615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3921  isocitrate lyase  83.21 
 
 		 527 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2573  isocitrate lyase  100 
 
 		 531 aa  1106    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1215  isocitrate lyase  75.33 
 
 		 533 aa  842    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2926  isocitrate lyase  78.56 
 
 		 531 aa  874    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.70995  normal  0.314009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0542  isocitrate lyase  82.67 
 
 		 528 aa  912    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2682  isocitrate lyase  79.47 
 
 		 531 aa  886    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000577171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3139  isocitrate lyase  77.55 
 
 		 526 aa  866    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3879  isocitrate lyase  83.21 
 
 		 528 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51448  normal  0.0498655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30050  isocitrate lyase  99.25 
 
 		 531 aa  1096    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1363  isocitrate lyase  56.14 
 
 		 535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  27.75 
 
 		 438 aa  153  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  28.63 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  28.42 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  26.78 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  29.85 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  27.55 
 
 		 428 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  27.26 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  27.39 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  28.54 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0999  isocitrate lyase  28.76 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  28.83 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  29.77 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  26.44 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  28.69 
 
 		 430 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  27.69 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  28.76 
 
 		 439 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  28.6 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3364  isocitrate lyase  29.18 
 
 		 441 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3602  isocitrate lyase  29.18 
 
 		 441 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  27.48 
 
 		 435 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  27.52 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  28.4 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3196  isocitrate lyase  28.97 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0249331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  28.48 
 
 		 1110 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  29.49 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  27.09 
 
 		 432 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  27.48 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  28.57 
 
 		 432 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  27.29 
 
 		 425 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4502  isocitrate lyase  27.79 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  28.76 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  27.27 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0763  isocitrate lyase  26.5 
 
 		 431 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1739  isocitrate lyase  26.16 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  27.85 
 
 		 439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  29.18 
 
 		 441 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  27.38 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3389  isocitrate lyase  29.18 
 
 		 441 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  26.35 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  26.42 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  26.98 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  27.36 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  29.18 
 
 		 441 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0923  isocitrate lyase  29.08 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  27.72 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  27.81 
 
 		 435 aa  135  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  26.85 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  27.87 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0365  isocitrate lyase  26.61 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1415  isocitrate lyase  27.87 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0295  isocitrate lyase  26.61 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.474355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  26.88 
 
 		 431 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  28.25 
 
 		 443 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0451  isocitrate lyase  27.6 
 
 		 436 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  27.13 
 
 		 434 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  27.47 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  28.12 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>