More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0047 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4878  isocitrate lyase  80.53 
 
 		 544 aa  894    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2573  isocitrate lyase  78.83 
 
 		 531 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1232  isocitrate lyase  73.91 
 
 		 527 aa  818    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2353  isocitrate lyase  72.97 
 
 		 527 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000102131  decreased coverage  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2234  isocitrate lyase  73.96 
 
 		 527 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305365  decreased coverage  0.0000429136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3724  isocitrate lyase  79.7 
 
 		 528 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1090  isocitrate lyase  78.49 
 
 		 531 aa  895    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.198066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1180  isocitrate lyase  71.89 
 
 		 534 aa  810    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1627  isocitrate lyase  64.39 
 
 		 528 aa  717    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0384  isocitrate lyase  79.36 
 
 		 528 aa  865    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0304  isocitrate lyase  68.68 
 
 		 531 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0047  isocitrate lyase  100 
 
 		 530 aa  1104    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3157  isocitrate lyase  87.12 
 
 		 542 aa  963    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4188  isocitrate lyase  81.63 
 
 		 545 aa  917    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0755941  normal  0.12145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28420  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 531 aa  868    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.528136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0610  isocitrate lyase  78.75 
 
 		 527 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3465  isocitrate lyase  76.08 
 
 		 530 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1448  isocitrate lyase  65.15 
 
 		 527 aa  728    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  normal  0.373019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4199  isocitrate lyase  82.04 
 
 		 545 aa  915    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1029  isocitrate lyase  79.02 
 
 		 531 aa  888    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12313  isocitrate lyase  64.2 
 
 		 552 aa  715    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1379  isocitrate lyase  81.29 
 
 		 545 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0529  isocitrate lyase  79.7 
 
 		 528 aa  866    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4053  isocitrate lyase  81.63 
 
 		 545 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2041  isocitrate lyase  73.86 
 
 		 527 aa  832    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2407  isocitrate lyase  77.08 
 
 		 531 aa  861    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210555  normal  0.138791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1860  isocitrate lyase  64.39 
 
 		 528 aa  717    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01326  isocitrate lyase  71.78 
 
 		 531 aa  801    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.190818  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4737  isocitrate lyase  78.75 
 
 		 526 aa  861    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613526  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4340  isocitrate lyase  80.27 
 
 		 528 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0943  isocitrate lyase  78.64 
 
 		 530 aa  897    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.478615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3921  isocitrate lyase  79.13 
 
 		 527 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5860  isocitrate lyase  79.13 
 
 		 527 aa  862    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0317025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4801  isocitrate lyase  79.7 
 
 		 528 aa  864    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.815542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2926  isocitrate lyase  82.42 
 
 		 531 aa  927    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.70995  normal  0.314009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1215  isocitrate lyase  70.7 
 
 		 533 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2682  isocitrate lyase  75.19 
 
 		 531 aa  835    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000577171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3139  isocitrate lyase  74.19 
 
 		 526 aa  834    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3879  isocitrate lyase  80.08 
 
 		 528 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51448  normal  0.0498655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30050  isocitrate lyase  78.64 
 
 		 531 aa  868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0542  isocitrate lyase  79.13 
 
 		 528 aa  865    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4447  isocitrate lyase  79.13 
 
 		 527 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1363  isocitrate lyase  56.75 
 
 		 535 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  28.31 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  26.56 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  26.35 
 
 		 428 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  29.01 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  27.6 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  28.09 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  26.65 
 
 		 432 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1739  isocitrate lyase  26.68 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  27.48 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  28.29 
 
 		 430 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  27.99 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  25.81 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  29.16 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  27.51 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  31.19 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  28.99 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  28.83 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  27.4 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  28.12 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  26.15 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  27.18 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  27.73 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  28.12 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  28.12 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1625  isocitrate lyase  28.91 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270498  normal  0.451985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  28.12 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  26.59 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0267  isocitrate lyase  28.64 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00619067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4502  isocitrate lyase  27.6 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  28.86 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  26.74 
 
 		 425 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1415  isocitrate lyase  26.89 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  28.24 
 
 		 434 aa  127  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  26.63 
 
 		 435 aa  127  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  27.85 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  27.85 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  28.09 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  28.53 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  27.24 
 
 		 425 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  28.92 
 
 		 443 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  27.24 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  27.24 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  27.24 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  25.79 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  27.24 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  27.9 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  28.57 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  27.85 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>