More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1739 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1739  isocitrate lyase  100 
 
 		 426 aa  885    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  65.26 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  65.49 
 
 		 428 aa  594  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  64.3 
 
 		 438 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  64.61 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  65.08 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  64.85 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  64.61 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  65.02 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  64.35 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  64.51 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 422 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  64.22 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  64.16 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  65.14 
 
 		 435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  63.94 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  63.53 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  65.38 
 
 		 435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  65.14 
 
 		 435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  64.35 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  63.92 
 
 		 443 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 475 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  64.66 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  64.66 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  63.4 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  64.03 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  62.68 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  63.08 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  62.53 
 
 		 443 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 475 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  64.66 
 
 		 435 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  62.62 
 
 		 434 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  64.11 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  63.7 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  65.05 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  64.66 
 
 		 435 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  64.42 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  64.66 
 
 		 435 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  63.03 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  62.97 
 
 		 434 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  62.97 
 
 		 434 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  64.32 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  63.7 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  61.72 
 
 		 422 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  60.19 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1317  isocitrate lyase  62.7 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  63.08 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  62.24 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  62.24 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  60.97 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1344  isocitrate lyase  62.36 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3042  isocitrate lyase  62.36 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1239  isocitrate lyase  62.33 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  62.24 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1308  isocitrate lyase  62.36 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0590884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  61.66 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  60.64 
 
 		 441 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  62 
 
 		 440 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3389  isocitrate lyase  60.41 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  60.69 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3602  isocitrate lyase  61.1 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  61.07 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0267  isocitrate lyase  61.2 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00619067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  60.69 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5339  isocitrate lyase  61.94 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641563  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  61.85 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  60.92 
 
 		 434 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  60.69 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  60.18 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  60.69 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  60.64 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  60.23 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  60.23 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  59.95 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  60.23 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  60 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3196  isocitrate lyase  59.95 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0249331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  59.63 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0295  isocitrate lyase  61.07 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  60.23 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  59.91 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  60.97 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  60.23 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  61.61 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0640  isocitrate lyase  60.84 
 
 		 435 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0281046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0801  isocitrate lyase  60.77 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  61.2 
 
 		 438 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0365  isocitrate lyase  61.07 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  59.77 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>