More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3364 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  70.32 
 
 		 434 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  95.24 
 
 		 441 aa  883    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004371  isocitrate lyase  79.32 
 
 		 437 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  73.74 
 
 		 432 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  70.09 
 
 		 435 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  95.01 
 
 		 441 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  78.86 
 
 		 450 aa  718    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1239  isocitrate lyase  78.59 
 
 		 440 aa  715    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01042  isocitrate lyase  79.32 
 
 		 437 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0451  isocitrate lyase  70.88 
 
 		 436 aa  653    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  72.89 
 
 		 434 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  78.59 
 
 		 440 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3364  isocitrate lyase  100 
 
 		 441 aa  921    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0640  isocitrate lyase  72.85 
 
 		 435 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0281046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1889  isocitrate lyase  71.14 
 
 		 438 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0265968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  76.36 
 
 		 439 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 435 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1317  isocitrate lyase  78.36 
 
 		 441 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  72.4 
 
 		 435 aa  665    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 435 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  72.44 
 
 		 434 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3196  isocitrate lyase  97.73 
 
 		 441 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0249331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1744  isocitrate lyase  73.3 
 
 		 438 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000180609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4617  isocitrate lyase  70.29 
 
 		 471 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417878  hitchhiker  0.00173468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  76.08 
 
 		 432 aa  693    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2438  isocitrate lyase  76.77 
 
 		 442 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  70.78 
 
 		 431 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 435 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 475 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2401  isocitrate lyase  72.79 
 
 		 443 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.782792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3602  isocitrate lyase  95.69 
 
 		 441 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0267  isocitrate lyase  78.56 
 
 		 437 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00619067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3042  isocitrate lyase  78.36 
 
 		 441 aa  713    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  74.09 
 
 		 439 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  72.89 
 
 		 434 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  70.09 
 
 		 435 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  72.62 
 
 		 435 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1308  isocitrate lyase  78.36 
 
 		 441 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0590884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  74.32 
 
 		 439 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  72.95 
 
 		 439 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  72.37 
 
 		 434 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  77.95 
 
 		 441 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 435 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2449  isocitrate lyase  78.51 
 
 		 436 aa  716    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.155678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  72.89 
 
 		 434 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 435 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1415  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 441 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  70.48 
 
 		 431 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  71.72 
 
 		 435 aa  661    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4502  isocitrate lyase  71.72 
 
 		 435 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  95.01 
 
 		 441 aa  882    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  71.75 
 
 		 434 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2552  isocitrate lyase  73.47 
 
 		 438 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  72.89 
 
 		 434 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  72.95 
 
 		 439 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  78.82 
 
 		 440 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  78.46 
 
 		 439 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1447  isocitrate lyase  72.56 
 
 		 443 aa  670    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  78.59 
 
 		 440 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1344  isocitrate lyase  78.36 
 
 		 441 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  77.73 
 
 		 438 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  69.86 
 
 		 475 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  71.92 
 
 		 434 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  72.89 
 
 		 434 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3088  isocitrate lyase  70.07 
 
 		 443 aa  646    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486018  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0295  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.474355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3389  isocitrate lyase  95.24 
 
 		 441 aa  884    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.580592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  72.67 
 
 		 434 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1247  isocitrate lyase  72.46 
 
 		 437 aa  670    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.725065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  78.82 
 
 		 440 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  72.67 
 
 		 434 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0365  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  69.41 
 
 		 435 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  69.63 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  69.63 
 
 		 435 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  69.41 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  69.63 
 
 		 435 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  69.41 
 
 		 443 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  68.95 
 
 		 435 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  71.16 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  68.72 
 
 		 434 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  68.72 
 
 		 434 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  68.37 
 
 		 443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  65.98 
 
 		 428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  67.49 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  66.59 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  67.37 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  64.3 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  64.07 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  64.07 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  64.07 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  63.3 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  66.82 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  64.07 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>