53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1418 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  35.67 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  33.13 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  28.14 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.95 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  26.74 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.18 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  28.14 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.95 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  31.76 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  29.14 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.14 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  30.46 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  31.28 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.52 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  28.18 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  30.53 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  25.57 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  26.82 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  27.62 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  31.14 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  37.25 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.08 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.09 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  30.85 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  28.02 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  31.82 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  28.57 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  28.25 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  28.81 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  30.34 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  27.49 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  28.65 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  26.88 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  31.63 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.01 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  24.56 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  25.42 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  26.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  27.91 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  27.44 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  26.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  26.52 
 
 		 181 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  27.68 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.68 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.37 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  30.81 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  29.65 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  27.59 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  28.74 
 
 		 186 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  23.73 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>