67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1379 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0373776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  96.92 
 
 		 228 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  70.35 
 
 		 226 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  34.65 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  47.54 
 
 		 575 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 566 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 563 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  40 
 
 		 567 aa  52.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 559 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  35.35 
 
 		 1141 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  39.29 
 
 		 570 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 578 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0431  hypothetical protein  51.92 
 
 		 65 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  38.36 
 
 		 891 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  31.78 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 557 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  40 
 
 		 577 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 568 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  41.51 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.86 
 
 		 557 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  36.92 
 
 		 574 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  29.73 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 553 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0921  hypothetical protein  45.28 
 
 		 65 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0948  hypothetical protein  45.28 
 
 		 65 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  28.91 
 
 		 563 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  35.38 
 
 		 574 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  47.17 
 
 		 570 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.62 
 
 		 703 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 574 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.62 
 
 		 703 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.91 
 
 		 562 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.35 
 
 		 566 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.5 
 
 		 653 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  37.74 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 561 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 		 440 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 573 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  40 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 		 624 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 849 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.93 
 
 		 556 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.03 
 
 		 698 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.25 
 
 		 568 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 586 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2725 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  39.29 
 
 		 366 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  39.29 
 
 		 383 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  39.29 
 
 		 587 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  33.93 
 
 		 387 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  32.69 
 
 		 576 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40 
 
 		 591 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  32.61 
 
 		 366 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 626 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  44.44 
 
 		 1017 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.18 
 
 		 571 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 570 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.71 
 
 		 693 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 491 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  35 
 
 		 569 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.51 
 
 		 573 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 569 aa  42  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.31 
 
 		 578 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 277 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  33.93 
 
 		 391 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>