More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1370 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 373 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  89.46 
 
 		 370 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  94.91 
 
 		 373 aa  727    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  97.86 
 
 		 373 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  76.31 
 
 		 370 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  72.02 
 
 		 371 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  72.02 
 
 		 371 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  66.29 
 
 		 366 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  59.23 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  53.22 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 		 399 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  24.92 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.95 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.95 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  32.11 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.58 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  32.46 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.02 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  29.55 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.73 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 507 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.66 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.66 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  27.59 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  26.12 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  25.79 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.74 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 655 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  25.78 
 
 		 385 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  25.33 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 820 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  30.77 
 
 		 803 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.27 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  29.54 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  24.85 
 
 		 373 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  25.96 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.3 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  24.54 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>