More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1332 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  100 
 
 		 576 aa  1131    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  34.74 
 
 		 613 aa  353  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  36.97 
 
 		 571 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  38.54 
 
 		 599 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  34.75 
 
 		 586 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.07 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.67 
 
 		 586 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  29.45 
 
 		 625 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  33.58 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.24 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.17 
 
 		 611 aa  253  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  29.4 
 
 		 600 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 		 599 aa  233  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.85 
 
 		 603 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  28.74 
 
 		 594 aa  226  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  27.9 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  27.9 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  28.7 
 
 		 583 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  27.9 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  28.21 
 
 		 612 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  28.07 
 
 		 568 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  32.12 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  27.34 
 
 		 605 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  26.09 
 
 		 585 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  29.14 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  31.01 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  28.7 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  29.89 
 
 		 583 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  27.83 
 
 		 628 aa  203  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  28.43 
 
 		 605 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  28.01 
 
 		 599 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  32.65 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  27.36 
 
 		 613 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.54 
 
 		 564 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.47 
 
 		 564 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  26.68 
 
 		 585 aa  180  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  29.98 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.31 
 
 		 601 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  27.12 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.16 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  29.44 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  27.19 
 
 		 610 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  25.3 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.74 
 
 		 564 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  28.19 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  27.04 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  25.6 
 
 		 603 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  27.34 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.76 
 
 		 582 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.77 
 
 		 612 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  28.96 
 
 		 608 aa  167  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.59 
 
 		 575 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  43.52 
 
 		 582 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  28.75 
 
 		 626 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.18 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.95 
 
 		 712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.37 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  28.43 
 
 		 613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  31.39 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  30.78 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.45 
 
 		 600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.26 
 
 		 712 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  26.93 
 
 		 604 aa  163  9e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  43.12 
 
 		 706 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.08 
 
 		 720 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  43.44 
 
 		 637 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.05 
 
 		 727 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  28.15 
 
 		 647 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.86 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  24.33 
 
 		 607 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  28.12 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  26.4 
 
 		 700 aa  161  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.15 
 
 		 598 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  27.13 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  27.41 
 
 		 601 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  29.23 
 
 		 575 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.4 
 
 		 638 aa  160  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.93 
 
 		 600 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  28.26 
 
 		 712 aa  160  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  25.94 
 
 		 587 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  41.82 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4827  ABC transporter related  39.44 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3339  ABC transporter related  39.44 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4176  ABC transporter related  39.44 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 609 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.88 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  27.82 
 
 		 649 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.6 
 
 		 594 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  27.77 
 
 		 582 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  40 
 
 		 724 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  27.2 
 
 		 613 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  40 
 
 		 724 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  27.13 
 
 		 588 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.56 
 
 		 596 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  42.53 
 
 		 637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>