57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1057 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  100 
 
 		 335 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  97.02 
 
 		 336 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  85.67 
 
 		 333 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  82.39 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  43.4 
 
 		 450 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  40.71 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  40.71 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  31.83 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  29.55 
 
 		 426 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  29.76 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  32.07 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  31.33 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  31.18 
 
 		 399 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.51 
 
 		 385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  32.63 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  31.24 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  31.36 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  29.26 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  28.07 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.38 
 
 		 432 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.24 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.28 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  27.68 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  27.64 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  27.62 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.92 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.77 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  27.93 
 
 		 515 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  27.59 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.77 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  28.76 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.9 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.87 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  25.46 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.36 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.18 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.73 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  26.29 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.29 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  26.5 
 
 		 548 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 551 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  25.98 
 
 		 550 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  29.66 
 
 		 639 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  87.5 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  23.54 
 
 		 531 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  26.56 
 
 		 581 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26.88 
 
 		 561 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  28.91 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  32.46 
 
 		 533 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  27.27 
 
 		 518 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  26.52 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  25.32 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  26.52 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  25.32 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  29.79 
 
 		 529 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  29.91 
 
 		 561 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>