161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52120 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  100 
 
 
310 aa  645    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  32.05 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  29.5 
 
 
405 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
264 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  25.81 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  32.64 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  26.43 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  29.52 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  26.47 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  31.97 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  29.86 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  24 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
259 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
250 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.28 
 
 
265 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
257 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  28.77 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  26.16 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.28 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.97 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.69 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.69 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.69 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
495 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  30.99 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  25 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  25.16 
 
 
273 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.11 
 
 
235 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.86 
 
 
207 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
246 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
250 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
256 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  29.58 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  23.72 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  23.63 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  28.17 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.83 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  28.3 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.14 
 
 
207 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  26 
 
 
267 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  26.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.28 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.83 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>