66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37507 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37507  small subunit of the nuclear mRNA cap-binding protein complex CBC  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201062  normal  0.0819638 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06142  small subunit of nuclear cap-binding protein complex (AFU_orthologue; AFUA_2G08570)  41.14 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.040408  normal  0.207556 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04290  20 kda nuclear cap binding protein (ncbp), putative  48.62 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  40.98 
 
 		 173 aa  97.4  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13520  predicted protein  44.34 
 
 		 127 aa  94.7  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00556924  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.43 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  32.63 
 
 		 101 aa  51.2  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  32.31 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 		 97 aa  50.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  36.49 
 
 		 319 aa  50.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  30.26 
 
 		 455 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  35.14 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  28.95 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  29.73 
 
 		 102 aa  47.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  26.27 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 		 109 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  29.73 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  35.94 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 90 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  35.62 
 
 		 117 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  43.48 
 
 		 90 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.89 
 
 		 95 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01340  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09490)  28.4 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  41.3 
 
 		 103 aa  44.3  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 96 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  37.31 
 
 		 387 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  25.69 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  25.69 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13095  predicted protein  30.14 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  27.03 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04570  poly(A) binding protein, putative  25.32 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0559902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  35.29 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  28.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  36.96 
 
 		 102 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  35.71 
 
 		 434 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  26.67 
 
 		 819 aa  41.6  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  29.07 
 
 		 105 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 		 115 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  27.63 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  27.85 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 111 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 304 aa  41.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  27.4 
 
 		 110 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  31.07 
 
 		 769 aa  40.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.73 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  26.03 
 
 		 856 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  29.79 
 
 		 524 aa  40.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  30.14 
 
 		 96 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 89 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  31.08 
 
 		 103 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  36.96 
 
 		 99 aa  40.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>