38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_52094 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  100 
 
 		 319 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  43.23 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  41.07 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  39.66 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  32.21 
 
 		 360 aa  172  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  30.25 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  30.03 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  30.36 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  27.81 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  29.15 
 
 		 262 aa  99.4  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  27.86 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  28.97 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  35.96 
 
 		 197 aa  92.8  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  28.98 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  25.95 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  25.76 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  25 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  26.32 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  27.68 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  34.41 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  26.37 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  25.75 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  24.57 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  28.52 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  25.43 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  30 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  25.96 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  60.78 
 
 		 180 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  60.78 
 
 		 180 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  23.67 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  58.82 
 
 		 180 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  26.3 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  22.38 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  24.4 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  22.78 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  25.26 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  27.55 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  25.6 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>