33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48699 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  60.87 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  59.81 
 
 
216 aa  265  5e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  60.29 
 
 
221 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  60.19 
 
 
226 aa  262  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  44.91 
 
 
182 aa  141  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  46.25 
 
 
182 aa  141  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  44.91 
 
 
178 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.27 
 
 
182 aa  135  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  41.32 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  40.88 
 
 
248 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  39.76 
 
 
170 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  40.96 
 
 
168 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  41.32 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  37.65 
 
 
170 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  40.25 
 
 
173 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  39.62 
 
 
172 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  41.51 
 
 
171 aa  118  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  40.12 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  41.88 
 
 
175 aa  116  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  39.62 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  38.55 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  41.1 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  36.75 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  36.75 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  40.58 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  37.35 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  35 
 
 
176 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  35.62 
 
 
176 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  36.65 
 
 
176 aa  108  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  36.25 
 
 
176 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  36.65 
 
 
176 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  32.93 
 
 
169 aa  96.3  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>