225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46479 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46479  translation initiation factor eif-2bgamma  100 
 
 		 758 aa  1563    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_969  predicted protein  27.97 
 
 		 693 aa  277  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  26.6 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10459  translation initiation factor eif-2b epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12530)  26.83 
 
 		 704 aa  246  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05090  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, putative  28.1 
 
 		 757 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  24.48 
 
 		 367 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  23.87 
 
 		 361 aa  98.2  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  23.81 
 
 		 361 aa  97.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  23.19 
 
 		 361 aa  95.1  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  22.27 
 
 		 854 aa  85.1  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  23.61 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  23.13 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  22.54 
 
 		 370 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  21.66 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  22.32 
 
 		 842 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  20.77 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  21.67 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  20.76 
 
 		 841 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  23.4 
 
 		 818 aa  71.2  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  22.09 
 
 		 836 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  20.34 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  20.4 
 
 		 348 aa  70.1  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  21.67 
 
 		 835 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  20.62 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 830 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  22.7 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  20.39 
 
 		 836 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  18.72 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  18.72 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  22.3 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  22.41 
 
 		 835 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  21.36 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  22.44 
 
 		 842 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  19.74 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  18.72 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  18.72 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  20.28 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  21.86 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  21.17 
 
 		 842 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  20.67 
 
 		 833 aa  63.9  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  18.48 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  18.48 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  20.43 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  18.48 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  21.38 
 
 		 835 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  27.91 
 
 		 248 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.92 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  20 
 
 		 836 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  19.77 
 
 		 392 aa  62  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  20.94 
 
 		 843 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 234 aa  60.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  19.85 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 345 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  20.83 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  20.83 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.82 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  18.03 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  20.94 
 
 		 840 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  18.68 
 
 		 832 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  18.59 
 
 		 832 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  30.37 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  20.28 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  21.39 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  18.99 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  20.53 
 
 		 836 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  22.06 
 
 		 346 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  24.19 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  27.82 
 
 		 240 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  22.48 
 
 		 820 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 828 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  22.25 
 
 		 399 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  19.75 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  23.85 
 
 		 816 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  19.78 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  23.37 
 
 		 222 aa  55.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  29.37 
 
 		 348 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  37.5 
 
 		 359 aa  55.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 383 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.92 
 
 		 354 aa  54.3  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  21.52 
 
 		 392 aa  54.7  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  17.92 
 
 		 785 aa  54.3  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  26.21 
 
 		 841 aa  54.3  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  41.1 
 
 		 359 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  19.08 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  29.37 
 
 		 476 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 		 242 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0531  nucleotidyl transferase  20.4 
 
 		 324 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3012  hypothetical protein  37.31 
 
 		 172 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  28.67 
 
 		 345 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1419  nucleotidyl transferase  23.22 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0198372  hitchhiker  0.00414302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  25.17 
 
 		 833 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 		 238 aa  52.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  20 
 
 		 399 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  19.7 
 
 		 359 aa  52  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3818  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 		 344 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  20.42 
 
 		 324 aa  51.6  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  20.8 
 
 		 842 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 223 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>