More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81885 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  100 
 
 		 726 aa  1499    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10459  translation initiation factor eif-2b epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12530)  39.47 
 
 		 704 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_969  predicted protein  29.26 
 
 		 693 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05090  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, putative  27.02 
 
 		 757 aa  270  8e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46479  translation initiation factor eif-2bgamma  26.5 
 
 		 758 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  25.7 
 
 		 820 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  24.94 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  23.15 
 
 		 367 aa  98.6  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  22.73 
 
 		 836 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  22.69 
 
 		 835 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  21.74 
 
 		 818 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 854 aa  95.1  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  22.31 
 
 		 828 aa  90.9  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  23.61 
 
 		 324 aa  90.1  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  21.97 
 
 		 836 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  21.16 
 
 		 835 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  23.26 
 
 		 784 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  20.67 
 
 		 820 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  21.99 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  21.88 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  25.87 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  21.88 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  22.95 
 
 		 842 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  22.38 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  23.32 
 
 		 776 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.63 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  21.15 
 
 		 784 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  21.15 
 
 		 784 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  23.04 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  21.63 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.15 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  21.14 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  22.79 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  22.46 
 
 		 841 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  25.18 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  22.41 
 
 		 843 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  23.34 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  23.19 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  22.16 
 
 		 384 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  22.09 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  20.81 
 
 		 842 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  21.5 
 
 		 842 aa  78.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  21.87 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  21 
 
 		 785 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  23.87 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  24.08 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  22.09 
 
 		 830 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  24.76 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  22.3 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  20.69 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  24.15 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  21.93 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  21.47 
 
 		 361 aa  73.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  21.14 
 
 		 837 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  21.73 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  20.72 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  23.32 
 
 		 834 aa  71.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  22.6 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  21.84 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  23.02 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  20.88 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  21.2 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  21.28 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  23.49 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  19.95 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  21.72 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  21.46 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  21.5 
 
 		 832 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  21.21 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  22.36 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  21.48 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  21.46 
 
 		 357 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  22.28 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  25.26 
 
 		 364 aa  66.6  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  20.09 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  20.29 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  19.39 
 
 		 818 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  20.9 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  21.6 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  23 
 
 		 827 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  21.41 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  21.23 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 841 aa  64.7  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  24.52 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  20.1 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  20.1 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  21.41 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  22.27 
 
 		 388 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  21.47 
 
 		 349 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  27.91 
 
 		 234 aa  63.9  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  25.76 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  21.34 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 836 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  29.77 
 
 		 238 aa  62  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  23.19 
 
 		 399 aa  62  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  21.66 
 
 		 403 aa  62  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  22.14 
 
 		 830 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>