More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23862 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_23862  predicted protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  48.39 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  47.5 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  50.18 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 360 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  46.9 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  46.43 
 
 		 360 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  46.42 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  47.24 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  48.38 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 360 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 360 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  49.24 
 
 		 358 aa  244  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 361 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  45.55 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  46.21 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  49.1 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2066  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 360 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2179  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 360 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0912707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2460  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 360 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00177456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 360 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0775  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  47.35 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  46.1 
 
 		 366 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  47.12 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1990  peptide chain release factor 1  50.4 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00333479  decreased coverage  0.0018191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2114  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  47.1 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2407  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3664  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  44.8 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  46.83 
 
 		 359 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  46.83 
 
 		 377 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  45.13 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  45.13 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  45.68 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0850  peptide chain release factor 1  49.6 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  46.98 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3687  peptide chain release factor 1  51.46 
 
 		 360 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  45.26 
 
 		 360 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 359 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  45.13 
 
 		 360 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  45.85 
 
 		 361 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  45.23 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  47.12 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  45.49 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  44.8 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  50.4 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41024  predicted protein  51.43 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  45.91 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  46.83 
 
 		 357 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0148  peptide chain release factor 1  44.96 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.570569  normal  0.18601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  44.09 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  46.95 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.6 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  45.04 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  45.52 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  45.88 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  44.4 
 
 		 359 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  43.32 
 
 		 361 aa  231  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  43.32 
 
 		 361 aa  231  9e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>