More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18202 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  43.08 
 
 		 1104 aa  724    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  100 
 
 		 882 aa  1806    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  46.19 
 
 		 819 aa  728    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 825 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 805 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.02 
 
 		 805 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  44.72 
 
 		 797 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  50.06 
 
 		 936 aa  772    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  42.63 
 
 		 807 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  50.06 
 
 		 936 aa  772    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  45.01 
 
 		 814 aa  721    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 800 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 853 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  45.79 
 
 		 815 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  43.95 
 
 		 799 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 800 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  44.07 
 
 		 799 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  44.64 
 
 		 809 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 816 aa  668    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  45.82 
 
 		 1309 aa  634  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 808 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 805 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 805 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  43.32 
 
 		 800 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  42.68 
 
 		 805 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  47.72 
 
 		 798 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 		 791 aa  603  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  39.85 
 
 		 775 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  41.4 
 
 		 778 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  41.05 
 
 		 817 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  40.36 
 
 		 806 aa  582  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  39.88 
 
 		 774 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  39.34 
 
 		 810 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  40.37 
 
 		 775 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  39.46 
 
 		 846 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  38.92 
 
 		 776 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  39.14 
 
 		 814 aa  562  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  39.38 
 
 		 792 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 776 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 776 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 773 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  39.63 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 776 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  38.79 
 
 		 776 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 773 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  39.66 
 
 		 797 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 804 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  38.77 
 
 		 769 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  41.11 
 
 		 880 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  41.06 
 
 		 805 aa  558  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  38.79 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  41.78 
 
 		 856 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  40.92 
 
 		 825 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  39.16 
 
 		 815 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  38.15 
 
 		 773 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  38.27 
 
 		 776 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  40.32 
 
 		 797 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  38.5 
 
 		 809 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  37.81 
 
 		 825 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  39.53 
 
 		 817 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  38.36 
 
 		 797 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  40.2 
 
 		 768 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  39.5 
 
 		 816 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  38.66 
 
 		 840 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  40.29 
 
 		 819 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  39.61 
 
 		 812 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  39.85 
 
 		 816 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  39.85 
 
 		 816 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  39.69 
 
 		 802 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  38.41 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  38.01 
 
 		 836 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 817 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  37.72 
 
 		 835 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  38.79 
 
 		 773 aa  545  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  38.52 
 
 		 828 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  38.84 
 
 		 806 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  37.88 
 
 		 820 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  38.57 
 
 		 817 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  37.83 
 
 		 898 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  39.8 
 
 		 802 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  39.95 
 
 		 788 aa  542  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  38.94 
 
 		 815 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  38.13 
 
 		 800 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  38.66 
 
 		 798 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  38.94 
 
 		 806 aa  538  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 		 801 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  39.11 
 
 		 802 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  38.79 
 
 		 798 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  38.61 
 
 		 843 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  38.66 
 
 		 798 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 806 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  39.1 
 
 		 823 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 806 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  39.71 
 
 		 810 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 804 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  38.44 
 
 		 772 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  37.29 
 
 		 816 aa  532  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  39 
 
 		 806 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  38.96 
 
 		 802 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>