82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt14 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0017  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 84 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.344367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0051  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 80 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0040  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.850401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60580  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0012  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0185  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t25  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0035  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000717769  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.661326  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>