231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0072 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0062  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0063  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0086  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378994  normal  0.691474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>