More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1758 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 92 aa  115  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 91 aa  110  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  54.65 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  57.47 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  56.1 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  54.88 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  53.01 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 87 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0642  ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.43351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  50 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  54.65 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  53.66 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.9  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  50 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>