More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2761 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  74.37 
 
 
475 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2571  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  74.79 
 
 
483 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
484 aa  964    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1473  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  68.83 
 
 
480 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  74.42 
 
 
480 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  73.08 
 
 
485 aa  719    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  99.38 
 
 
484 aa  959    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.115126  normal  0.467258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.38 
 
 
452 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.64 
 
 
452 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1163  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like  32.07 
 
 
507 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.63442  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0805  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.99 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0580  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.84 
 
 
476 aa  117  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.58 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  29.26 
 
 
476 aa  110  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 
585 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
501 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.23 
 
 
521 aa  107  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  28.07 
 
 
559 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.61 
 
 
565 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  28.35 
 
 
498 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  29.64 
 
 
501 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  28.23 
 
 
493 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.22 
 
 
513 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  26.28 
 
 
506 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0706  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  25.08 
 
 
458 aa  103  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.409683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.14 
 
 
538 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.35 
 
 
538 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  28.14 
 
 
531 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  28.82 
 
 
486 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.27 
 
 
472 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.53 
 
 
501 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  25.38 
 
 
500 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
479 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  25.45 
 
 
525 aa  100  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  29.91 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  26.55 
 
 
480 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.08 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.05 
 
 
512 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  27.03 
 
 
617 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  28.74 
 
 
498 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.97 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.4 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.77 
 
 
535 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  28.53 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.77 
 
 
535 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  31.56 
 
 
488 aa  97.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.4 
 
 
500 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0648  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.19 
 
 
498 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0663  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.19 
 
 
498 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000080828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  26.32 
 
 
540 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 
737 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.17 
 
 
592 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.52 
 
 
552 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.38 
 
 
661 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.71 
 
 
672 aa  96.7  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  25.38 
 
 
525 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.13 
 
 
495 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  24.29 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  27.41 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  28.01 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.85 
 
 
538 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  25.87 
 
 
506 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.26 
 
 
525 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.61 
 
 
534 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  27.27 
 
 
649 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  27.14 
 
 
500 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  26.15 
 
 
683 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  28.36 
 
 
673 aa  94.7  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.55 
 
 
532 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.43 
 
 
959 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  29.73 
 
 
654 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  28.96 
 
 
500 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  25.47 
 
 
480 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  26.65 
 
 
499 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.77 
 
 
562 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  27.52 
 
 
505 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  26.69 
 
 
561 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  26.65 
 
 
500 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.18 
 
 
997 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.62 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.24 
 
 
544 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  28.79 
 
 
679 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.59 
 
 
547 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0350  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.56 
 
 
982 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  26.11 
 
 
505 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.68 
 
 
545 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.75 
 
 
544 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  25.64 
 
 
533 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  28.79 
 
 
662 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.24 
 
 
539 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
1047 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  27.57 
 
 
504 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  26.91 
 
 
498 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.32 
 
 
523 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.36 
 
 
672 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0681  NADH dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
584 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.389184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.09 
 
 
488 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0693  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.3 
 
 
510 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  27.54 
 
 
796 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>