More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2845 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  88.19 
 
 		 256 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  57.25 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  46.18 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  43.04 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  43.55 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  46.93 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  39.62 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  40.91 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.38 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  41.91 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  40.52 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  43.6 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  40.34 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  35.32 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  46.67 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  42.92 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  41.77 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  40.47 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  40.47 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  34.85 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  36.78 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  35.51 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.53 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  38.58 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  38.52 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  38.98 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  43.58 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  35.92 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  33.98 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  37.01 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.35 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.35 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  35.1 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.44 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.73 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  38.59 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  37.5 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  38.39 
 
 		 444 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  34.73 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.64 
 
 		 418 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  33.2 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  40.49 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  36.17 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.02 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.24 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  35.29 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  35.5 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  36.03 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.33 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  33.18 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  32.22 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  32.38 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  35.91 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  32.77 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  33.98 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  32.16 
 
 		 280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  37.08 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  35.37 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  32.43 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.08 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  32.64 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  34.4 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  34.29 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  36.55 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 252 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.22 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1183  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113445  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  39.34 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  34.11 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  33.81 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  33.33 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>