More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1183 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1183  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113445  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  40.29 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.73 
 
 
322 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  39.23 
 
 
278 aa  147  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  40.29 
 
 
256 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  33.98 
 
 
265 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
256 aa  141  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.65 
 
 
260 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  37.1 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  36.23 
 
 
285 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  35.75 
 
 
257 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  35.75 
 
 
257 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  33.49 
 
 
264 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  33.64 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  40.98 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  35.44 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  38.01 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
269 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 
277 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  36.89 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  33.99 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  33.02 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  34.93 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  34.42 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  31.34 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  35.29 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  39.11 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  34.47 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  34.93 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.83 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  36.41 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  35.19 
 
 
266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
257 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.78 
 
 
258 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  33.01 
 
 
262 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  34.45 
 
 
278 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
252 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 
257 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  32.52 
 
 
260 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  34.5 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  34.63 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  34.4 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  32.35 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.2 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.81 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  36.22 
 
 
262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  35.56 
 
 
272 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  33.49 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  35.29 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  39.7 
 
 
252 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.68 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  30.05 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  34.72 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  34.83 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 
255 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
260 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  36.19 
 
 
256 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 
254 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.21 
 
 
266 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  34.11 
 
 
274 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  31.34 
 
 
257 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  34.83 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  36.61 
 
 
247 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  40.35 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  32.18 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  34.98 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  32.84 
 
 
263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.84 
 
 
263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  34.95 
 
 
267 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  32.04 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.58 
 
 
268 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  31.82 
 
 
254 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  38.65 
 
 
264 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  32.34 
 
 
278 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
276 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.33 
 
 
271 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  36.84 
 
 
255 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.61 
 
 
259 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.66 
 
 
250 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  33.33 
 
 
271 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  31.37 
 
 
266 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  32.7 
 
 
269 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  34.63 
 
 
259 aa  105  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  31.37 
 
 
286 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  31.88 
 
 
258 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  35.2 
 
 
421 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  30.56 
 
 
264 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  30.92 
 
 
427 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 
276 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>