33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  92.8 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  30.45 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  32.71 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  31.75 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  28.44 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  25.66 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  24 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  24.9 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  29.72 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  27.62 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  26.98 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.73 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  27.52 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  24.77 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.61 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  23.05 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  20.36 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  20.36 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  20.36 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  20.35 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  22.22 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  22.22 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  22.35 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>