42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  85.48 
 
 		 199 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  77.6 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  72.38 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  70.17 
 
 		 198 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  68.33 
 
 		 185 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  59.89 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  59.78 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
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NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  61.54 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  57.3 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  50.91 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  47.4 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  30.05 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  36.31 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
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NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
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NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
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NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
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NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
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NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
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NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
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NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
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NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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