More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  100 
 
 		 122 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  90.98 
 
 		 122 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  55.17 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  55.75 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  55.75 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  52.54 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  51.26 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  52.1 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  52.1 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  52.1 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  52.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  52.1 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  52.17 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  48.31 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  40.16 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  47.37 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  43.09 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  41.61 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  38.52 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  36.22 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  38.98 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  39.32 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  39.32 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  35.71 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  39.58 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  35.96 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  34.21 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  35.09 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  35.09 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  35.09 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.14 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  33.05 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  38.74 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  33.72 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  38.74 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  38.14 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  38.18 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  38.18 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  39.22 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  39.22 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  38.18 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  42.67 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  32.32 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  43.21 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  31.36 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  28.46 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>