More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  100 
 
 		 172 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  88.37 
 
 		 172 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  51.19 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  49.69 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  47.9 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2276  CinA domain-containing protein  44.94 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906635  hitchhiker  0.00967543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  41.51 
 
 		 259 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  43.04 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  43.51 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0164  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.04 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  41.5 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  47.15 
 
 		 514 aa  97.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  38.92 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  39.62 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  44.59 
 
 		 422 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  32.18 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  40.82 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  51.46 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  40.82 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  40.82 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  39.63 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  51.46 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  39.46 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  48.25 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.28 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  45.53 
 
 		 514 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.53 
 
 		 514 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  38.31 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  36.49 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  41.82 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  45.21 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  38.65 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  38.16 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  42.5 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  39.24 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  35.8 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1627  competence damage-inducible protein A  36.02 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000853954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  38.89 
 
 		 431 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  35.62 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  36.18 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  37.34 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  39.61 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  35.37 
 
 		 275 aa  84.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  41.12 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  36.71 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.61 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  41.72 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  39.13 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  47.52 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  43.48 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1703  competence damage-inducible protein A  35.85 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0296412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  40.15 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  40.49 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  37.09 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  40.88 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2153  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0198899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2121  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000221747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  36.69 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  36.31 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1746  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00125275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  40.4 
 
 		 422 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  37.75 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  42.14 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  34.1 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  43.41 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01496  competence damage-inducible protein A  40.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000206349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2108  CinA domain protein  40.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000498834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  42.61 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01507  hypothetical protein  40.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000417567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  42.37 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  37.75 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  39.76 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  37.97 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  41.22 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  35.88 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  42.61 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  35.88 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  34.36 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  35.88 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>