35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  89.45 
 
 
256 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  44.44 
 
 
253 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  44.8 
 
 
253 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  47.79 
 
 
255 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  42.86 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  40.08 
 
 
258 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  47.81 
 
 
251 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  44.09 
 
 
259 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  47.15 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  44.09 
 
 
259 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  44.49 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  45.06 
 
 
259 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.89 
 
 
524 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  28.44 
 
 
523 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.58 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.68 
 
 
490 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  27.96 
 
 
517 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.53 
 
 
558 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.86 
 
 
522 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.32 
 
 
721 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.96 
 
 
467 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 
719 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  32.21 
 
 
496 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.14 
 
 
445 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.12 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.25 
 
 
505 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  27.44 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.36 
 
 
521 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2160  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.15 
 
 
490 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.23 
 
 
333 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>