More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18591 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 129 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  79.84 
 
 		 129 aa  213  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  78.91 
 
 		 129 aa  210  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  78.12 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  51.94 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  42.52 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  40.62 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  41.27 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  38.89 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  38.52 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  42.62 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  41.46 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  39.17 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  41.18 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  39.2 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  42.28 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  37.7 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  41.53 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  38.71 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  39.83 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  40.65 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  42.28 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  38.1 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  41.88 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  40.5 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  38.52 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  36.89 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  37.21 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  37.7 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  40.83 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  40.68 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  39.2 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  38.98 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>