More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25491 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  100 
 
 		 415 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  53.25 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  47.36 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  54.64 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  39.45 
 
 		 418 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  38.71 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.08 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.85 
 
 		 415 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.6 
 
 		 415 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.36 
 
 		 415 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.98 
 
 		 904 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.31 
 
 		 909 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.73 
 
 		 903 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.65 
 
 		 909 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.54 
 
 		 903 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  37.69 
 
 		 907 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.33 
 
 		 903 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.83 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.19 
 
 		 854 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.86 
 
 		 873 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  34.03 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.72 
 
 		 867 aa  123  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  37.93 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  25.24 
 
 		 890 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  29.84 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  41.41 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  25.12 
 
 		 865 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  32.37 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  32.58 
 
 		 883 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.1 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.48 
 
 		 847 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  45.6 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  33.05 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  28.64 
 
 		 881 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  24.08 
 
 		 885 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.31 
 
 		 877 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.45 
 
 		 845 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.9 
 
 		 888 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  24.51 
 
 		 877 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  32.25 
 
 		 902 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 859 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33.5 
 
 		 872 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 		 875 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 863 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  37.5 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.5 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.78 
 
 		 907 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  33.5 
 
 		 880 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  32.34 
 
 		 875 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.78 
 
 		 898 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.13 
 
 		 888 aa  103  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  34.8 
 
 		 880 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.66 
 
 		 863 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  30.84 
 
 		 874 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.09 
 
 		 821 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  33.04 
 
 		 904 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.67 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  34.46 
 
 		 875 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.32 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  36.45 
 
 		 880 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.48 
 
 		 448 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.89 
 
 		 880 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  36.81 
 
 		 523 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  25.06 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 499 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 		 552 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1047  polynucleotide adenylyltransferase region  29.14 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0195166  normal  0.488797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  23.92 
 
 		 896 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  39.41 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.89 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 525 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  37.28 
 
 		 567 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  36.57 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  38.38 
 
 		 488 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  31.64 
 
 		 479 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  37.16 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  37.14 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  31.44 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.32 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  39.05 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  37.56 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.17 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>