More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11311 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11311  ABC transporter  100 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1040  ABC transporter  98.85 
 
 		 261 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11311  ABC transporter  96.55 
 
 		 261 aa  477  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.871959  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11231  ABC transporter  92.66 
 
 		 262 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1032  manganese ABC transporter  76.83 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19021  ABC transporter  76.83 
 
 		 261 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.49622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15251  ABC transporter  76.63 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1606  ABC transporter  45.06 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0233225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1366  ABC transporter  46.19 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29261  ABC transporter  48.15 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  37.97 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  34.71 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.65 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.44 
 
 		 280 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.74 
 
 		 281 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  35.1 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  35.1 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.93 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.08 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.85 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.02 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.85 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.85 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.85 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.85 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.24 
 
 		 280 aa  99  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  31.38 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  35.62 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  29.72 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  27.05 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  26.64 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.87 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.87 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  28.63 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  26.16 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.81 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.36 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.81 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  33.05 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.02 
 
 		 279 aa  88.6  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 294 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  25 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.54 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.74 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.74 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  27.49 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  27.11 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  25.6 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  28.98 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  27.52 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.4 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.41 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  27.85 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  24.58 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  28.45 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  26.87 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  26.91 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  26.91 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  25.94 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  27.75 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.57 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.27 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  25.74 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  28.24 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.51 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  24.08 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  25.32 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  29.08 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  27.59 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  28.26 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  30.84 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  26.13 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>