83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4173 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  61.69 
 
 		 257 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  61.69 
 
 		 257 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  62.92 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  55.42 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  55.42 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  55.42 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  50.42 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  51.06 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  51.82 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  54.59 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  47.35 
 
 		 252 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  49.38 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  52.12 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  48.95 
 
 		 242 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  29.37 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  27.6 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  28.14 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  27.94 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  29.53 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  29.86 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.36 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  32.81 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.81 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  28.72 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.1 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.19 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.43 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.95 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  35.44 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  41.56 
 
 		 165 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.19 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 126 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.28 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.57 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.02 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.18 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.63 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.96 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.94 
 
 		 189 aa  45.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  36.96 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  36.96 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.36 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  36.84 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.48 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.73 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.73 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.65 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.73 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.43 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  32.22 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  32.22 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  32.73 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  32.5 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  35.87 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.77 
 
 		 218 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.77 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.17 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.17 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.17 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.06 
 
 		 205 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>