More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2250 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
606 aa  1220    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  43.02 
 
 
660 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
664 aa  246  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
662 aa  243  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 
678 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.49 
 
 
645 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
609 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 
600 aa  233  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
639 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.8 
 
 
640 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
642 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
636 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.08 
 
 
574 aa  230  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
647 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
605 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.1 
 
 
628 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 
640 aa  220  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 
610 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 
643 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
640 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 
613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.07 
 
 
681 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 
610 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.22 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.38 
 
 
615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
647 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  27.72 
 
 
652 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 
630 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 
619 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.52 
 
 
611 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
632 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  36 
 
 
596 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  31.23 
 
 
615 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 
629 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.48 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  29.83 
 
 
617 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 
691 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
607 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.68 
 
 
600 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
637 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 
646 aa  207  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 
597 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
681 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
634 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.69 
 
 
631 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 
617 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 
645 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  28.84 
 
 
643 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 
603 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 
586 aa  205  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
631 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 
646 aa  203  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
617 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.01 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 
602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31 
 
 
629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
631 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 
602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
595 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 
610 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
709 aa  200  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  28.66 
 
 
641 aa  200  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.73 
 
 
637 aa  200  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 
598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35.55 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  28.3 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 
618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
655 aa  198  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 
618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 
618 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
630 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  34.52 
 
 
626 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 
631 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
629 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 
618 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 
618 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 
618 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  28.85 
 
 
618 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 
633 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 
648 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 
646 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  29.48 
 
 
524 aa  195  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  28.22 
 
 
631 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 
612 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 
612 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 
597 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  26.74 
 
 
649 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
822 aa  194  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 
618 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 
636 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 
634 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  28.23 
 
 
618 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  28.89 
 
 
608 aa  194  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
618 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
618 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  28.38 
 
 
631 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 
634 aa  193  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  25.56 
 
 
588 aa  193  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>