More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3407 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3407  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
333 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0543  ribose ABC transporter, permease protein  93.99 
 
 
333 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0696377  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0545  ribose ABC transporter, permease protein  93.99 
 
 
333 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  77.48 
 
 
336 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  78.19 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  77.26 
 
 
334 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5264  monosaccharide-transporting ATPase  58.2 
 
 
331 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249777  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2908  inner-membrane translocator  49.85 
 
 
330 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  51.75 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.48 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  47.76 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  48.64 
 
 
333 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6150  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  49.85 
 
 
330 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2684  monosaccharide-transporting ATPase  49.23 
 
 
330 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3273  inner-membrane translocator  48.49 
 
 
330 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449838  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  48.42 
 
 
322 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2824  inner-membrane translocator  50.91 
 
 
346 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  41.82 
 
 
324 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
311 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.1 
 
 
311 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.1 
 
 
311 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 
311 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.78 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.78 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.78 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  34.57 
 
 
329 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 
309 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  39.58 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  35.65 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.09 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 
348 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  39.4 
 
 
310 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.71 
 
 
358 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.96 
 
 
322 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.43 
 
 
327 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 
313 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.83 
 
 
324 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.78 
 
 
327 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.65 
 
 
323 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 
354 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
310 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  36.86 
 
 
342 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.96 
 
 
322 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.56 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.99 
 
 
336 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  37.06 
 
 
388 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
312 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
314 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
334 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
345 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
334 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 
345 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  35.78 
 
 
365 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  36.74 
 
 
345 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.83 
 
 
350 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  34.14 
 
 
333 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
345 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
335 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
347 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 
356 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.54 
 
 
321 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.83 
 
 
346 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  37.66 
 
 
337 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.2 
 
 
325 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
337 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
337 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 
337 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
316 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
335 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.76 
 
 
334 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
328 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  36.96 
 
 
334 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
313 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.53 
 
 
322 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.25 
 
 
324 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>