More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1124 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  100 
 
 
416 aa  805    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  57.63 
 
 
426 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  51.84 
 
 
410 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  55 
 
 
414 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  56.02 
 
 
416 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  49.12 
 
 
401 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  48.61 
 
 
401 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  48.36 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  50.26 
 
 
402 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  58.53 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  54.4 
 
 
408 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  48.81 
 
 
399 aa  322  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  48.81 
 
 
399 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  48.81 
 
 
399 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  48.23 
 
 
398 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  50.79 
 
 
401 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  46.72 
 
 
411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  46.72 
 
 
411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  47.92 
 
 
406 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  46.46 
 
 
411 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  47.48 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  49.48 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  49.47 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  49.47 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  46.1 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  49.47 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  49.47 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  47.26 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  49.21 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  46.92 
 
 
411 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 
428 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  48.81 
 
 
394 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  48.48 
 
 
399 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.25 
 
 
399 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.25 
 
 
399 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  47.7 
 
 
403 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.5 
 
 
399 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  48.53 
 
 
411 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.3 
 
 
385 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  48.81 
 
 
394 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  48.81 
 
 
394 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  48.81 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  48.81 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  48.54 
 
 
394 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  51.01 
 
 
406 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  50.37 
 
 
443 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  51.01 
 
 
406 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 
405 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
399 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  43.72 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 
399 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  49.21 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  43.63 
 
 
404 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.88 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.32 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 
409 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  48.29 
 
 
329 aa  239  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  39.23 
 
 
393 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  41.33 
 
 
421 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  46.69 
 
 
413 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  48.31 
 
 
403 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
423 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.16 
 
 
415 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  50.35 
 
 
293 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  48.32 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.4 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  39.57 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  38.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  38.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  38.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  38.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  38.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  38.78 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 
418 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  38.78 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 
397 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  37.43 
 
 
401 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.39 
 
 
389 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.39 
 
 
389 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  37.09 
 
 
404 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
399 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  45.05 
 
 
397 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.36 
 
 
383 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  42.93 
 
 
395 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  37.72 
 
 
407 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.29 
 
 
403 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
389 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
415 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.49 
 
 
405 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.07 
 
 
400 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.88 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  36.98 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  37.83 
 
 
405 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  37.33 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>