271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_87422 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
477 aa  942    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  25 
 
 
413 aa  90.5  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
425 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 
392 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.82 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  23.89 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.95 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  31.68 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.75 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.63 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.83 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  29.49 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.85 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  23.5 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  22.51 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.7 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.34 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.56 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  20.82 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  22.95 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.19 
 
 
402 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.25 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.87 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.05 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.4 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  30.73 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  23.74 
 
 
536 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
394 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.65 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
402 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 
414 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 
427 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  20.76 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.09 
 
 
411 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  22.74 
 
 
424 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.09 
 
 
411 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  22.89 
 
 
424 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  32.43 
 
 
388 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  21.71 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.27 
 
 
399 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.27 
 
 
401 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.27 
 
 
399 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  20.09 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.76 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  31.52 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
408 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  30.25 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  25.99 
 
 
591 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  28.65 
 
 
442 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  25.38 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  29.25 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  24.58 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4548  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
400 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.78 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  21.32 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1934  major facilitator transporter  30.61 
 
 
385 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  30.07 
 
 
584 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  29.68 
 
 
421 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
424 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  31.68 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.71 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.71 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  31.34 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  28.87 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  28.67 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  24.26 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  29.63 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
489 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  29.34 
 
 
388 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  24.07 
 
 
406 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  27.13 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.95 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.07 
 
 
406 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  33.33 
 
 
508 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  33.33 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.19 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.33 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  29.87 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>