65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2943 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_2943  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
386 aa  770    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0626764  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  25.25 
 
 
483 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3441  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.39 
 
 
415 aa  94  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47105  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.74 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32724  predicted protein  25.59 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06870  MATE efflux family protein (Eurofung)  26.03 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30992  ethionine resistance protein  25.69 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.628726 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  24.3 
 
 
622 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54310  predicted protein  24.69 
 
 
606 aa  66.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0389645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  27.04 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
457 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_006686  CND03760  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
763 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  31.62 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
451 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  29.61 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  21.97 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  32.33 
 
 
480 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.68 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.06 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  30.08 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.06 
 
 
477 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
460 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  30.6 
 
 
457 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  25 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  28.26 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  23.91 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  23.94 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  33.58 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  34.75 
 
 
479 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  23.37 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  23.37 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  23.37 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  23.37 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  23.37 
 
 
452 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  22.39 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  21.89 
 
 
452 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  22.83 
 
 
453 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  25.85 
 
 
472 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
458 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  27.97 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.45 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  26.47 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.45 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  30.97 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  26.19 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  27.82 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  23.26 
 
 
458 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.12 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
478 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  25 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48159  predicted protein  21.74 
 
 
509 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
454 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
462 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0192  multi anti extrusion protein MatE  26.09 
 
 
475 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.684576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>