More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1732 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  50.84 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.72 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 392 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 386 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 374 aa  175  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.44 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.66 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.11 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.11 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.11 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 410 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.57 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.24 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.54 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.54 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.39 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.46 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  39.76 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.76 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  34.96 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.22 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.83 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.04 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  35.37 
 
 		 435 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.19 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.15 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  35.42 
 
 		 372 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  35.42 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  34.32 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  35.27 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.2 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  38.27 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  38.27 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  34.32 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  29.47 
 
 		 450 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.95 
 
 		 512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  30.51 
 
 		 420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.09 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.08 
 
 		 443 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.19 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.42 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.76 
 
 		 516 aa  99  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.35 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.19 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.04 
 
 		 394 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  30.49 
 
 		 358 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.36 
 
 		 453 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.42 
 
 		 445 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.41 
 
 		 495 aa  95.9  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  33.18 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 489 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.16 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  27.18 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  27.18 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  27.18 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.5 
 
 		 407 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.47 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.27 
 
 		 406 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.54 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.87 
 
 		 471 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.1 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.3 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  28.22 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.53 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.93 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  28.24 
 
 		 335 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 		 432 aa  92.8  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  28.57 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  32.65 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  32.65 
 
 		 337 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  32.65 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  32.65 
 
 		 338 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 475 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.62 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  27.87 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  32.14 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  28.15 
 
 		 472 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.82 
 
 		 476 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  32.11 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  31.58 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.15 
 
 		 404 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  32.11 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.92 
 
 		 393 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.81 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>