More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1487 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  100 
 
 		 452 aa  891    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  31.99 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  31.62 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  31.83 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  31.86 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  31.6 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  31.86 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  33.25 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  31.6 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  31.36 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  31.36 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  31.36 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  32 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.11 
 
 		 753 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  22.67 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.63 
 
 		 468 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 462 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  22.19 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.09 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.51 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.77 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.71 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  26.81 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.8 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.87 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.32 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.02 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 745 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.05 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  22.34 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.55 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  22.52 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.34 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.25 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.34 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.34 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  21.77 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.34 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  22.97 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.38 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.34 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  25.63 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  23.94 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  23.94 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>