36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1007 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1007  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 504 aa  955    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 255 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 109 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  45.9 
 
 		 324 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.31 
 
 		 292 aa  50.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0841  Lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02472  murein hydrolase D  33.67 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.84 
 
 		 801 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  44.26 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  47.17 
 
 		 1079 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  50 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 203 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  53.33 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  40.98 
 
 		 187 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  47.27 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40.68 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  47.83 
 
 		 320 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  55.56 
 
 		 332 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 849 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  53.33 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 		 128 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  57.45 
 
 		 301 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.25 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  46.51 
 
 		 695 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  51.11 
 
 		 515 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  51.11 
 
 		 515 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 539 aa  43.9  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  29.53 
 
 		 1116 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 518 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>