166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0237 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0237  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1448  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.84 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000730135  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.545731 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  27.55 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01860  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285542  normal  0.653902 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  23.4 
 
 		 267 aa  72  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  22.45 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 439 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  24.68 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.33 
 
 		 326 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 308 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  32 
 
 		 304 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 322 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 309 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  27.95 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 506 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 512 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  23.72 
 
 		 320 aa  48.5  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 308 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  25.87 
 
 		 338 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  21.47 
 
 		 366 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 338 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 431 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.84 
 
 		 389 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 		 345 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 281 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 417 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  22.97 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02570  mitochondrion protein, putative  23.67 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30908  predicted protein  21.1 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  25.84 
 
 		 389 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  24.88 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.93 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  38.57 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  30.56 
 
 		 432 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.36 
 
 		 339 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  42.19 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  20.92 
 
 		 366 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.81 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0593  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 326 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  31.87 
 
 		 432 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  30.11 
 
 		 308 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  26.32 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.92 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 450 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 321 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  26.28 
 
 		 327 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.97 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  26.67 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 381 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.7 
 
 		 324 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 435 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 330 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 		 302 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  29.41 
 
 		 854 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 304 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  30 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  42.19 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.39 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.16 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.05 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.16 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  30.49 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  25.35 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  30.59 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>