More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1254 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 337 aa  695    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  44.05 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0799  octaprenyl-diphosphate synthase  33.22 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.286745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.09 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  35.71 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.53 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  40.64 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.06 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  38.16 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  42.06 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.85 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  37.05 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  34.34 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  41.59 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.53 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  36.59 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.71 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  34.75 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  34.75 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  36 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.21 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  42.08 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.9 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  37.72 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  39.38 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  40.58 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  39.91 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  37.28 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.34 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  36.05 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.8 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.95 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  38.05 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.71 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  40.09 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  39.25 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  36.05 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  36.05 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  36.84 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  32.08 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  41.2 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.06 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  38.81 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.62 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  34.32 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  33.96 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.71 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  38.5 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  38.96 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  36.9 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.63 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  37.23 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.96 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  36.29 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  36.29 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.58 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  34.59 
 
 		 323 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  36.29 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  38.25 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  39.81 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.59 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  38.32 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  34.93 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  33.66 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  38.43 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.43 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  32.34 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  41.28 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>