More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4592 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 523 aa  1008    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  58.61 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  56.42 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.02 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  59.6 
 
 		 538 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.19 
 
 		 522 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  52.16 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  56.38 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  54.83 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  53.94 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  54.21 
 
 		 518 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  54.21 
 
 		 518 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  54.21 
 
 		 518 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 510 aa  360  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.66 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 582 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 603 aa  240  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.35 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 600 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 639 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.98 
 
 		 559 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 579 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.33 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 603 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 584 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 536 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.33 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.21 
 
 		 525 aa  223  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 595 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 578 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.31 
 
 		 605 aa  220  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 575 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.81 
 
 		 567 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 542 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 559 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 525 aa  217  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 560 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 577 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 537 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 582 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 534 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 582 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 543 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 519 aa  213  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 567 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 581 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 593 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 543 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 583 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 559 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 556 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 579 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.71 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 579 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 579 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 579 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.99 
 
 		 583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.58 
 
 		 700 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  28.46 
 
 		 520 aa  196  7e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  34.63 
 
 		 585 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 579 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 567 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.08 
 
 		 587 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 564 aa  190  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.69 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.54 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>