More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3434 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  77.07 
 
 
516 aa  722    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
518 aa  1009    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  78.1 
 
 
519 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
518 aa  1009    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
518 aa  1009    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  77.37 
 
 
517 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  56.88 
 
 
520 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  58.55 
 
 
510 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  54.19 
 
 
508 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  55.83 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.67 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.56 
 
 
522 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  55.64 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  54.09 
 
 
523 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  54.28 
 
 
538 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  55.65 
 
 
511 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 
516 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  52.23 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  49.8 
 
 
529 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
574 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.92 
 
 
530 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.73 
 
 
585 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 
639 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
603 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.25 
 
 
559 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.26 
 
 
525 aa  247  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
560 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 
603 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  36.66 
 
 
545 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 
575 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
600 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.43 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.91 
 
 
605 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
542 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
539 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
579 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
577 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
546 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 
573 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
559 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
582 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
543 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
536 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
595 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
573 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
557 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
533 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 
559 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
578 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
572 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37 
 
 
567 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 
582 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
568 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
532 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.94 
 
 
591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
579 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
583 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
534 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
519 aa  213  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
529 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
552 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 
593 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.09 
 
 
528 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
582 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
519 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.34 
 
 
520 aa  207  3e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
582 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
548 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
537 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.73 
 
 
507 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
582 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
569 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
579 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
581 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.53 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.5 
 
 
583 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
546 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.41 
 
 
495 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
576 aa  199  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
540 aa  198  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
564 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
556 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 
573 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>